先天性副舟骨属先天性发育异常，原因不明。本病患者胫后肌走行的方向与常人不同。正常胫后肌肌腱是经过舟骨内端的“下面”，止于第2、3楔骨与第2、3跖骨底面。有副舟骨时，胫后肌肌腱走行于副舟骨内侧的“上面”，且比较牢固地止于副舟骨上，从而使胫后肌提起纵弓及使足内翻的作用丧失，结果极易引起平足，并引起相应症状。副舟骨易和内踝接触，妨碍足内翻。加上足外展肌反向收缩，久之发生足外翻和纵弓塌陷。患者行走时的摩擦，使局部发生滑囊炎及胫后肌腱鞘炎。
先天性副舟骨患者的局部可出现滑囊炎。滑囊炎是指滑囊的急性或慢性炎症。滑囊是结缔组织中的囊状间隙，是由内皮细胞组成的封闭性囊，内壁为滑膜，有少许滑液。少数与关节相通，位于关节附近的骨突与肌腱或肌肉、皮肤之间。凡摩擦力或压力较大的地方，都可有滑囊存在，其作用主要是有利于滑动，从而减轻或避免关节附近的骨隆突和软组织间的摩擦和压迫。许多关节的病变都可以引起该病。
先天性副舟骨患者的舟骨结节部位(副舟骨处)有骨性突起或饱满，有压痛。患者可有滑囊炎，抗阻力足内翻检查时阳性(足内侧痛加剧)。长时间行走及站立后出现足内侧疼痛，也可伴有足底疼痛，部分患者无不适症状，仅在因外伤等原因摄X线片时发现。
为预防先天性副舟骨疾病，适当进行婚前检查、婚前遗传咨询以了解双方有无遗传病史和其他可能遗传的疾病还可进行产前诊断以及分娩后患处的X光片检查等
先天性副舟骨患者X线片显示舟骨内后方有边缘整齐的小骨块，其密度和舟骨相同，有的在与舟骨结合处不规则，间或有囊性变，或结合部两侧骨质硬化，副舟骨可有散在的点状影或骨密度增高，先天性副舟骨可分为两种类型：
1、与舟骨分界清楚，呈圆形或不规则形，体积小，呈游离状。
2、副骨较大，与舟骨相连成钩状舟骨，但舟骨结节骨化中心仍在骨外，间有软骨连接。
先天性副舟骨患者的饮食应以清淡为主，注意多吃蔬菜水果，合理搭配膳食。患者应多吃含钙丰富的食物，如牛奶、豆类及其制品。还有含锌元素丰富的食物，如粗粮、豆类及其制品。另外注意适当的锻炼才能有助于对这些元素的消化和吸收。
先天性副舟骨患者无症状不需治疗。症状轻微者可减少活动量，穿着矫正鞋，或行石膏或支具固定治疗。对滑囊炎和胫后肌腱鞘炎可行曲安德龙局部注射治疗。对保守治疗效果欠佳者，可考虑手术治疗(Kidner手术)。手术方法为从内踝下至第1跖骨基底做一个足内侧向跖面呈弧形的切口，纵形切开筋膜、舟骨和内侧楔骨及跖骨颈的骨膜，并向上、下方翻开。从副舟骨的背侧和跖侧分离胫后肌腱，使之能滑到舟骨的下方。可预先凿一条骨沟，使胫后肌腱滑入沟内。胫后肌腱在舟骨上的附着点要小心保留，尽量不予剥下。当胫后肌腱滑下后，显露副舟骨，再用骨刀切除。如骨膜完整，将胫后肌肌腱缝合在骨膜上，或在舟骨上钻孔，紧缩固定胫后肌肌腱。术后小腿石膏托固定患足于内收、内旋位6周，然后换穿矫正鞋。